Kościołem do II poł XIX wieku zajmowali się ojcowie Augustianie, którzy po carskiej kasacji zakonów (w karze za wsparcie powstania) opuścili Polskę. Światynia przeszla w administrację diecezji. W czasie II wojny światowej pod gruzami zginal wraz z ludnością cywilną rektor kościoła. Po wojnie władza ludowa planowała stworzyć tu obiekt muzealny rozważano prezentację zniszczeń Warszawy lub muzeum ateizmu. W 1956 r. wrócił do władzy kościelnej. Ofiarowany przez Prymasa Wyszyńskiego Siostrom Franciszkankom Służebnicom Krzyża słuzy im do dzisiaj. Jest ośrodkiem duszpasterstwa niewidomych (wspomniane siostry założyły ośrodek w Laskach). Rektorami kościołą był ks. Bronisław Dembowski (uczestnik rozmów w Magdalence, obecny biskup-emeryt włocławski). Obecnym rektorem i jednocześnie duszpsterzem KIKu oraz niewidomych jest ks. Andrzej Gałka.
Autor informuje, że w rubryce Opinie znajdują się uwagi i spostrzeżenia nadesłane przez internautów odwiedzających stronę. Za ich treść autor nie ponosi odpowiedzialności.